Математические свойства агентной модели вымирания — реколонизации для популяционной генетики
https://doi.org/10.18255/1818-1015-2024-2-142-151
Аннотация
Агентная модель описывает динамику генетического разнообразия непрерывно распределенной популяции в случае конечного числа особей. В событии вымирания в некоторой области умирает часть популяции, после чего в ходе реколонизации рождаются новые особи с генотипом родителя. Мы рассматриваем модель, а также её модификацию, и получаем свойства, связанные с популяционными параметрами. В работе показано, что время жизни особей имеет экспоненциальное распределение, вероятности аллелей сохраняются во времени, средняя гетерозиготность при ограничении, связанном с числом особей при вымирании и реколонизации, равна аналогичной величине в модели Морана. Совместное распределение аллелей обобщено на случай популяций, непрерывно расположенных в пространстве. Совместное распределение аллелей и гетерозиготность посчитаны на симуляциях.
Об авторе
Никита Владимирович Гаянов
Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
Россия
Россия
Список литературы
1. R. Durrett and R. Durrett, Probability models for DNA sequence evolution. Springer, 2008.
2. J. Felsenstein, “A pain in the torus: some difficulties with models of isolation by distance,” The American Naturalist, vol. 109, no. 967, pp. 359–368, 1975.
3. A. M. Etheridge, “Survival and extinction in a locally regulated population,” The Annals of Applied Probability, vol. 14, no. 1, pp. 188–214, 2004.
4. A. Etheridge, Some Mathematical Models from Population Genetics: 'Ecole D''Et'e de Probabilit'es de Saint-Flour XXXIX-2009. Springer Science & Business Media, 2011.
5. N. Barton, A. Etheridge, and A. V'eber, “A New Model for Evolution in a Spatial Continuum,” Electronic Journal of Probability, vol. 15, pp. 162–216, 2010, doi: 10.1214/EJP.v15-741.
6. N. Biswas, A. Etheridge, and A. Klimek, “The spatial Lambda-Fleming-Viot process with fluctuating selection,” Electronic Journal of Probability, vol. 26, pp. 1–51, 2021, doi: 10.1214/21-EJP593.
7. A. M. Etheridge, A. V'eber, and F. Yu, “Rescaling limits of the spatial Lambda-Fleming-Viot process with selection,” Electronic Journal of Probability, vol. 25, pp. 1–89, 2020, doi: 10.1214/20-EJP523.
8. S. Guindon, H. Guo, and D. Welch, “Demographic inference under the coalescent in a spatial continuum,” Theoretical population biology, vol. 111, pp. 43–50, 2016.
9. T. A. Joseph, M. J. Hickerson, and D. F. Alvarado-Serrano, “Demographic inference under a spatially continuous coalescent model,” Heredity, vol. 117, no. 2, pp. 94–99, 2016.
10. R. L. Streit and R. L. Streit, The Poisson point process. Springer, 2010.
11. J. Wakely, Coalescent Theory: An Introduction. Macmillan Learning, 2016.
Рецензия
Для цитирования:
Гаянов Н.В. Математические свойства агентной модели вымирания — реколонизации для популяционной генетики. Моделирование и анализ информационных систем. 2024;31(2):142-151. https://doi.org/10.18255/1818-1015-2024-2-142-151
For citation:
Gaianov N.V. Mathematical properties of the agent-based model of extinction — recolonization for population genetics. Modeling and Analysis of Information Systems. 2024;31(2):142-151. (In Russ.) https://doi.org/10.18255/1818-1015-2024-2-142-151
Просмотров:
185
Послать статью по эл. почте 